P1140 相似基因

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  • 评测方式 云端评测
  • 标签 动态规划,动规,dp
  • 难度 普及/提高-
  • 时空限制 1000ms / 128MB

题解

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    题目背景

    大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列。它包含了4种核苷酸,简记作A,C,G,T。生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物。

    在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。

    题目描述

    两个基因的相似度的计算方法如下:

    对于两个已知基因,例如AGTGATG和GTTAG,将它们的碱基互相对应。当然,中间可以加入一些空碱基-,例如:

    这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的相似度如下表所示:

    那么相似度就是:(-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9。因为两个基因的对应方法不唯一,例如又有:

    相似度为:(-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14。规定两个基因的相似度为所有对应方法中,相似度最大的那个。

    输入输出格式

    输入格式:

    共两行。每行首先是一个整数,表示基因的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含A,C,G,T四个字母。1<=序列的长度<=100。

    输出格式:

    仅一行,即输入基因的相似度。

    输入输出样例

    输入样例#1: 复制
    7 AGTGATG
    5 GTTAG
    
    输出样例#1: 复制
    14
    
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